由于阿笠博士家的卫生间坏了，柯南·姜虎川(高山南配音)和小蓝(山崎和佳奈配音)以及海巴拉·艾(林原惠美饰演)一起去了公共浴室。柯南不小心滑倒撞到了头，然后被两个神秘的陌生人带走了。经过一番混乱之后，天才的骗子娜娜(由深见梨加配音)和神秘的杀手近藤(由香川照之配音)带着失去记忆的柯南去了一个僻静的别墅，假装成了他的父母，而阿笠博士和跟随近藤的格雷·普林斯则遭遇了一场严重的车祸。娜娜的一个犯罪团伙似乎计划用它来制造炸弹袭击。与此同时，杂志编辑水岛早苗(广末凉子配音)怀疑丈夫近藤有外遇，找到毛利小五郎调查丈夫的下落。随着时间的推移，一个邪恶的阴谋浮出水面...这部电影是柯南侦探漫画系列20周年纪念的特别项目。编剧邀请了《偷钥匙的方法》的导演兼编剧内田贤治来担任主角。香川照之和广末凉子被邀请再次在《小偷》中扮演他们的角色。