地球物理学家田中幸雄博士(小林桂树)带领他的团队进行了一次深海探险，结果却在海底发现了异常的裂缝和泥石流。经过一系列调查，他得出结论，日本列岛将在一年内沉没。然而，日本政府官员认为田边博士的预测只是一个值得相信的谎言。只有山本首相(由石坂浩二扮演)认识到形势的严重性，并任命靖国神社的前妻朝日鹰(由大地真央扮演)为危机管理部长，领导靖国神社博士和他们的团队试图拯救日本。很快，从北海道开始，日本岛屿发生了大规模的地质灾害，使日本陷入恐慌。政府对这场灾难不知所措。唯一的海外移民政策无法应对急剧恶化。日本岛屿完全沉没的现实即将上演。最终，田中博士和他的研究小组终于找到了拯救日本的方法，但这种方法的实际操作非常困难...这部电影改编自日本科幻作家小松樱子同名畅销小说。它耗资20亿日元，是近年来日本电影业投资和宣传最多的灾难电影。