科学家(扎克·加利费安纳基斯)属于美国政府的一个秘密部门。他们通过高科技手段训练豚鼠说话和思考，并把它们变成特工。然而，本的部门正面临着被联邦调查局关闭的局面。为了证明他和天竺鼠特工的能力，本命令天竺鼠特工队队长达尔文(由山姆·洛克威尔·山姆·洛克威尔配音)潜入比尔·奈伊萨布丽娜工业公司的首席执行官办公室，寻找罗纳德向中东国家出售可用于军事目的的高科技芯片的证据。达尔文没有忽视。他很快就让Blast(由崔西·摩根·崔西·摩根配音)、Valees(由佩内洛普·克鲁兹配音)、Flies Moche和speaks(由尼古拉斯·凯奇·尼古拉斯·凯奇配音)以及其他成员付诸行动。这群小但有特殊技能的豚鼠特工成功闯入罗纳德的办公室并下载了重要信息。然而，这种冒险才刚刚开始...